Le système de paiement mobile Payconiq répond aux plus hauts standards de sécurité en matière de paiement mobile et pour chaque opération de paiement, le client doit composer son code secret/PIN spécifique à Payconiq ou bien valider la transaction au moyen de son empreinte digitale. Par ailleurs, aucune donnée sensible ne figure dans le QR Code Payconiq, protégeant ainsi les professionnels lors des transactions.